صفحه اصلیگزارش آماریکتابخانه های مرکزیراهنماورود
رکورد قبلیرکورد بعدی
سرشناسه : شریف‌رحمانی، ادریس
عنوان اصلی : بررسی تغییرات ژنتیکی در سطح ژنوم افراد مبتلا به لنفوهیستیوسیتوز هموفاگوسیتیک خانوادگی از طریق تکنیک توالی یابی به روش اگزوم
پژوهشگر : ادریس شریف‌رحمانی
استاد راهنما : ارشد حسینی
استاد راهنما : حمزه رحیمی
استاد مشاور : نیما پروانه
مقطع تحصیلی : کارشناسی ارشد
رشته تحصیلی : زیست فناوری پزشکی
تاریخ دفاع : ۱۳۹۶
دانشگاه/ دانشکده : علوم پزشکی ایران
صفحه شمار : ‮‭۵۹‬ ص. ‬مصور
چکيده : نقص های ایمنی اولیه (PID) شامل بیش از 220 اختلال ژنتیکی هستند که موجب نقص در سیستم ایمنی انسان می شوند. بر اساس مطالعات انجام شده 6 میلیون نفر در سراسر جهان مبتلا به یکی از این اختلالات ایمنی هستند. گرچه شیوع این بیماری در کودکان بیشتر دیده می شود اما مواردی نیز در بزرگسالان گزارش شده است. لنفوهیستیوسیتوز هموفاگوسیتیک (HLH) یک بیماری سندرمی و یکی از انواع نقص های ایمنی اولیه است. مشخصه ی اصلی این بیماری التهاب کنترل نشده است که در اثر ترشح بیش از حد سایتوکین (cytokine) از سلول های فعال شده مثل لنفوسیت های سمی T (CTLs)، سلول های قاتل طبیعی (NK) و ماکروفاژها ایجاد می شود. شکل های اصلی این بیماری که ژنتیکی و اکتسابی هستند به ترتیب در اثر نقص ژنتیکی در سلول های CTL و NK (HLH خانوادگی) و همچنین در اثر عفونت ها، بیماری های خود ایمنی/ خودالتهابی و بدخیمی ها رخ می دهند. تب طولانی، بزرگی طحال و کبد و کاهش چند رده سلولی از علائم بیماری بشمار می روند. این بیماری اگر به موقع تشخیص داده نشود و اقدامات درمانی صورت نگیرد، باعث مرگ بیمار در دوران نوزادی می شود.تشخیص این بیماری براساس فنوتیپ می تواند مشکل باشد و همچنین به دلیل هتروژنی ژنی و لوکوسی تشخیص مولکولی این بیماری سخت و پر هزینه است. توالی یابی DNA جهت یافتن واریانت های بیماری زا یکی از راه های تشخیص این بیماری محسوب می شود. پیدایش نسل جدید توالی یابی (NGS) بخصوص توالی یابی اگزوم (WES) انقلابی شگرف در زمینه تشخیص مولکولی بیماری های مندلی ایجاد کرده است. به این صورت که تنها با انجام یک آزمایش، کلیه ی نواحی کد کننده پروتئین فرد توالی یابی می شود. در مقایسه با روش بررسی تک تک ژن ها این روش فوق العاده سریع و ارزان است. بخش اعظم چالش ها مربوط به این تکنیک، آنالیز اطلاعات حاصل از آن است که می بایست با طراحی استراتژی های خاصی اطلاعات را در بستر مناسبی آنالیز کرد و بدین ترتیب واریانت های بیماری زا را پیدا کرد. در این مطالعه مناطق اگزونی دو مبتلا به FHL-3 جهت یافتن تغییرات ژنتیکی با استفاده از تکنیک WES توالی یابی شد و اطلاعات حاصل از آن با استفاده از نرم افزار های بیوانفورماتیکی در سیستم عامل لینوکس آنالیز شد.بر اساس نتایج این مطالعه دو جهش بیماری زا در ژن UNC13D که منجر به بروز علائم کلینیکی دو بیمار مبتلا به FHL-3 شده بوند به وسیله تکنیک WES شناسایی شدند. به طور خلاصه نتایج این مطالعه نشان داد که استفاده از تکنیک WES جهت یافتن تغییرات ژنوم و تشخیص بیماری های ژنتیکی در بیماری های مثل نقص های ایمنی اولیه که هم از نظر فنوتیپی و هم ژنوتیپی پیچیدگی بالایی دارند، می تواند تشخیص مولکولی بیماران را سرعت بخشد و در نتیجه به روند بهبود وضعیت بیماران کمک شایانی کند.
: Human primary immunodeficiencies (PIDs) comprise at least 220 genetically-defined single-gene inherited disorders which have malfunction in immune system. Recent study revealed that six million people in worldwide have a form of PID. Although the prevalence of PIDs are seen in children, but also there are many adult patients. Hemophagocytic lymphohistiocytosis (HLH) is a type of immunodeficiency syndrome characterized by uncontrolled hyperinflammation resulting from high secretion of cytokine from activated cytotoxic T lymphocytes (CTLs) and natural killer (NK) and macrophage. Genetic defect in cytotoxic T lymphocytes (CTLs) and natural killer (NK) cells or associate with infections, autoinflammatory/autoimmune diseases and malignancies (acquired HLH). Symptom manifestation and laboratory findings associated with HLH patients are including prolonged fever, hepatosplenomegaly, cytopenia and increasing level of ferritin, triglycerides and decreasing level of fibrinogen. Diagnosis of PIDs based on phenotype is often complex, expensive and not always successful. Also allelic and locus heterogeneity increment the complexity of genetic analysis. Direct DNA sequencing is a diagnostic solution in order to find causative variants. Advances of next-generation sequencing (NGS) technologies, particularly whole exome sequencing (WES) had revolutionized the field of molecular diagnosis of Mendelian disorders which can replace traditional methods, by interrogation of a large sets of genes in the single test in timely and cost effective manner instead of gene-by-gene approaches. Main challenge related to NGS thechnology is data analysis which require sutible strategies to abtain reliable causative variants. In this study exom of two FHL-3 patiants were sequenced by WES and data has been analysied by bioinformatics tools in linux operating system.According to the results of this study, two disease-causing mutation which lead to clinical symptoms of two patients with FHL-3, identified by means of WES. Our result shown that WES is useful method to find pathogenic variant in PIDs as complex diseases.
موضوع : لنفوهیستوسیتوزیس هموفاگوستیک
: Lymphohistiocytosis, Hemophagocytic
: ‏ سندرم های کمبود ایمنی
: ‏ Immunologic Deficiency Syndromes
: ‏ تجزیه و تحلیل توالی دی ان آ
: ‏ ‏‏ اگزوم
: ‏‏ Exome

ارسال پیغام

آمار سامانه

تعداد دانشگاه ها :63
تعداد پایان نامه ها:315666
آخرین بروزرسانی:۱۴۰۰/۰۲/۲۱
کاربران آنلاین:1133
بازدید امروز:8943
بازدید کل:6676161

تماس با ما

شهرک قدس، بلوار فرحزادی، بلوار ایوانک، ساختمان مرکزی وزارت بهداشت، درمان وآموزش پزشکی، بلوک A، طبقه ۱۳، معاونت تحقیقات و فناوری ، مرکز توسعه وهماهنگی اطلاعات وانتشارات علمی، گروه اطلاع رسانی پزشکی

تلفن تماس: 81454318-021

توجه

کلیه حقوق این وب سایت و مطالب آن متعلق به مرکز توسعه و هماهنگی اطلاعات و انتشارات علمی معاونت تحقیقات و فناوری وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی بوده و هر استفاده از مطالب آن با ذکر منبع بلامانع است

DEVELOPED BY PARSAZARAKHSH
COPYRIGHT BY THESIS.RESEARCH.AC.IR ALL RIGHT RESERVED, IRAN, TEHRAN